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O Brasil recebe reconhecimento pela exportação da sua produção agrícola (Silva, Braga, & Garcia, 2015). Parte do avanço da produção agrícola se deve a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA), uma empresa pública de Pesquisa & Desenvolvimento (P&D), atuando nacional e internacionalmente. Desta forma, é necessário entender como se dá o alinhamento da estrutura organizacional e da gestão de P&D em empresa pública internacionalizada. Portanto, este estudo teve como objetivo analisar o alinhamento da estrutura organizacional e da gestão de P&D em empresa pública internacionalizada. A pesquisa qualitativa descritiva ocorreu por meio do método de caso único. A coleta de dados foi constituída por três entrevistas com gestores da organização e análise dos principais documentos estratégicos da organização, além do site da organização. Os dados foram sistematizados e foi realizada análise de conteúdo, com utilização do software IRAMUTEQ. Os resultados indicaram que a estrutura organizacional da EMBRAPA fornece arcabouço estrutural para a gestão de P&D, promovendo o compartilhamento de conhecimentos e infraestrutura. A internacionalização, especialmente via LABEX, permite a interação dos pesquisadores com centros de pesquisa de excelência. Isto faz com que o planejamento estratégico resulte em projetos de P&D, via macroprogramas, gerando inovações para a agropecuária brasileira.
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